生藥研發核酸純化工作站

Freedom EVO nucleic acid purification

Freedom EVO nucleic acid purification

FreedomEVO 核酸純化應用,專為處理大量多樣品的自動化DNA / RNA 純化而設計,並邀請純化耗材大廠MACHEREY-NAGEL 和 Promega 為合作夥伴共同開發,適用各種類型樣品的通量純化需求。

Tecan的Freedom EVO 是一個可彈性化使用的工作平台,可加裝模組套件擴充功能,使 純化、定量可以標準化的在同一平台上自動化的執行,或再加強整合以支援核酸純化後的下游工作(SNP、基因體、次世代定序 . . . 等 ) ,建構理想的完全自動化系統。

可應用的樣品領域

Tecan 與領先的核酸純化試劑供應商緊密合作,如Promega、Life Technologies 和 MACHEREY-NAGEL 共同開發研究用於PCR 和 定序 以及 基因組 等所需的 DNA、RNA 純化方法,廣泛應用於多種生物樣品,對 病毒核酸 和 質體 也一樣備有解決方案,其適用的生物領域如下 : 

植物

從幾毫克到1.5克的各種品種的植物和真菌純化DNA。

血液

從新鮮的、冷凍的人類血液,甚至更具挑戰性的動物樣本,操作體積從5 μl到10 ml。

體液

可純化病毒、病菌 核酸 從 200μl 體液,執行大規模篩檢項目。

生物組織

可從 20 mg 生物組織純化分離基因組DNA。

培養的細胞

最低可從僅含有107個細胞的樣本中,純化到核酸。

培養的細菌

純化基因組DNA 或 plasmid質體,操作最大體積 5毫升。

食物與製品

可操作200毫克檢體,包含飼料檢驗的核酸純化所需。

Freedom EVO nucleic acid purification 系統概述

高品質的核酸純化對於在傳染病、腫瘤學、人類遺傳學、個體化醫學 及 各種臨床基因體學分析 . . . 等領域 是最至關重要的基本工作,以 Freedom EVO工作站為主體的平台加上可彈性化選用的模組,建構出一套依實驗需求的客製自動化系統,無論是從血液、血漿、體液或 新鮮 和 FFPE (Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded) 的組織樣品 中提取 DNA、RNA 甚至是細胞外游離的DNA(ccfDNA),並可自動化的進行核酸定量。

Freedom EVO HSM 工作站構成

這是一個搭配 Promega HSM (Heater Shaker Magnet) 技術的案例,並非唯一的選擇搭配 ! HSM 是一套結合 磁力沉降分離 與 加熱、振盪器功能的模組,可以取代離心功能,但如有特殊需求,本系統一樣可以輕易整合離心機。

一般血液的最初上樣操作體積從 1~10 ml 都有(通常使用 10 ml Vacutainer) ,圖示的 Freedom EVO HSM 搭配 Promega HSM 模組 始並使用Promega 套裝試劑組 :

  1. 核心平台 : 依通量可選用 Freedom EVO 100/150,可以透過八通道分注頭 處理 1 到 96 個樣品,或者使用 96通道分注頭 進行更快速的純化。若要更高通量 或 整合上下游其他工作,可考慮 Fluent平台系統 此平台可對 96 孔微盤 和384 孔微盤 的操作規格作切換。

  2. Promega HSM 2.0 : 加熱器、振盪器,磁力沉降 多工模組。

  3. 試劑、溶液 分配系統

  4. Air LiHa 分注頭

其他 :

  • 電腦、觸控螢幕、Freedom EVOware Standard software為標準必需配備

  • PosID integrated barcode scanner for tubes and plates 條碼管理系統為選購配備

  • Cooling carriers for PCR plates and reagent 樣品、試劑 需要於低溫操作時選購

工作流程

1.選擇目的

選擇核酸純化要對應的使用目的領域,此為示範畫面,可依需求建置,畫面選項會依功能設定而有所增減。

2.Data input options

設定試劑、溶液 使用體積、樣品編號,上樣的玻璃試管內樣品轉移目的地(離心管、微孔盤、其他)

3.Worktable loading

透過視覺化管理檢視工作台,識別每種 試劑、樣品 和 應放置用具,在上面放置確切的資訊,每個項目所需的數量和體積,以便完成運行。

4.試劑確認

檢查 試劑、溶液 分配系統 是否能足量供應,廢棄 Tip 回收槽是否清空。

5.模組檢查

檢查安裝在平台上的模組,是否正常開啟,與系統是否正常連線。

6.執行

透過觸控螢幕即時監視,工作執行到那個程序。

可擴充選用模組

樣品掃描條碼管理 Sample tracking – PosID

Te-Shake 是帶有加熱功能(最高80°C)的微孔盤振盪器。

如果考慮固相萃取(SPE),Te-VacS 是抽負壓的模組,但必須搭配 RoMa Arm 以抓取、組合SPE組件。

Te-MagS 磁力沉降分離模組,專用於 診斷 和 生物製藥實驗室,用以分離純化 DNA、RNA、proteins、完整細胞。

Inheco機載熱循環儀模組(ODTC)直接在平台上執行PCR實驗。

加裝整合離心機,除了生物樣品前處理,亦可作為分離純化的方案。

MACHEREY-NAGEL 磁力沉降分離模組,分離純化核酸。

如果有分析、定量 需求可整合 reader,亦可與TECAN 系統作自動化整合。

應用實例