生藥研發核酸純化工作站
Freedom EVO nucleic acid purification
Freedom EVO nucleic acid purification
FreedomEVO 核酸純化應用,專為處理大量多樣品的自動化DNA / RNA 純化而設計,並邀請純化耗材大廠MACHEREY-NAGEL 和 Promega 為合作夥伴共同開發,適用各種類型樣品的通量純化需求。
Tecan的Freedom EVO 是一個可彈性化使用的工作平台,可加裝模組套件擴充功能,使 純化、定量可以標準化的在同一平台上自動化的執行,或再加強整合以支援核酸純化後的下游工作(SNP、基因體、次世代定序 . . . 等 ) ,建構理想的完全自動化系統。
可應用的樣品領域
Tecan 與領先的核酸純化試劑供應商緊密合作,如Promega、Life Technologies 和 MACHEREY-NAGEL 共同開發研究用於PCR 和 定序 以及 基因組 等所需的 DNA、RNA 純化方法,廣泛應用於多種生物樣品,對 病毒核酸 和 質體 也一樣備有解決方案,其適用的生物領域如下 :
植物
從幾毫克到1.5克的各種品種的植物和真菌純化DNA。
血液
從新鮮的、冷凍的人類血液,甚至更具挑戰性的動物樣本,操作體積從5 μl到10 ml。
體液
可純化病毒、病菌 核酸 從 200μl 體液,執行大規模篩檢項目。
生物組織
可從 20 mg 生物組織純化分離基因組DNA。
培養的細胞
最低可從僅含有107個細胞的樣本中,純化到核酸。
培養的細菌
純化基因組DNA 或 plasmid質體,操作最大體積 5毫升。
食物與製品
可操作200毫克檢體,包含飼料檢驗的核酸純化所需。
Freedom EVO nucleic acid purification 系統概述
高品質的核酸純化對於在傳染病、腫瘤學、人類遺傳學、個體化醫學 及 各種臨床基因體學分析 . . . 等領域 是最至關重要的基本工作,以 Freedom EVO工作站為主體的平台加上可彈性化選用的模組,建構出一套依實驗需求的客製自動化系統,無論是從血液、血漿、體液或 新鮮 和 FFPE (Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded) 的組織樣品 中提取 DNA、RNA 甚至是細胞外游離的DNA(ccfDNA),並可自動化的進行核酸定量。
Freedom EVO HSM 工作站構成
這是一個搭配 Promega HSM (Heater Shaker Magnet) 技術的案例,並非唯一的選擇搭配 ! HSM 是一套結合 磁力沉降分離 與 加熱、振盪器功能的模組,可以取代離心功能,但如有特殊需求,本系統一樣可以輕易整合離心機。
一般血液的最初上樣操作體積從 1~10 ml 都有(通常使用 10 ml Vacutainer) ,圖示的 Freedom EVO HSM 搭配 Promega HSM 模組 始並使用Promega 套裝試劑組 :
核心平台 : 依通量可選用 Freedom EVO 100/150,可以透過八通道分注頭 處理 1 到 96 個樣品,或者使用 96通道分注頭 進行更快速的純化。若要更高通量 或 整合上下游其他工作,可考慮 Fluent平台系統 此平台可對 96 孔微盤 和384 孔微盤 的操作規格作切換。
Promega HSM 2.0 : 加熱器、振盪器,磁力沉降 多工模組。
試劑、溶液 分配系統
Air LiHa 分注頭
其他 :
電腦、觸控螢幕、Freedom EVOware Standard software為標準必需配備
PosID integrated barcode scanner for tubes and plates 條碼管理系統為選購配備
Cooling carriers for PCR plates and reagent 樣品、試劑 需要於低溫操作時選購
工作流程
1.選擇目的
選擇核酸純化要對應的使用目的領域,此為示範畫面,可依需求建置,畫面選項會依功能設定而有所增減。
2.Data input options
設定試劑、溶液 使用體積、樣品編號,上樣的玻璃試管內樣品轉移目的地(離心管、微孔盤、其他)。
3.Worktable loading
透過視覺化管理檢視工作台,識別每種 試劑、樣品 和 應放置用具,在上面放置確切的資訊,每個項目所需的數量和體積,以便完成運行。
4.試劑確認
檢查 試劑、溶液 分配系統 是否能足量供應,廢棄 Tip 回收槽是否清空。
5.模組檢查
檢查安裝在平台上的模組,是否正常開啟,與系統是否正常連線。
6.執行
透過觸控螢幕即時監視,工作執行到那個程序。
可擴充選用模組
樣品掃描條碼管理 Sample tracking – PosID
Te-Shake 是帶有加熱功能(最高80°C)的微孔盤振盪器。
如果考慮固相萃取(SPE),Te-VacS 是抽負壓的模組,但必須搭配 RoMa Arm 以抓取、組合SPE組件。
Te-MagS 磁力沉降分離模組,專用於 診斷 和 生物製藥實驗室,用以分離純化 DNA、RNA、proteins、完整細胞。
Inheco機載熱循環儀模組(ODTC),直接在平台上執行PCR實驗。
加裝整合離心機,除了生物樣品前處理,亦可作為分離純化的方案。
MACHEREY-NAGEL 磁力沉降分離模組,分離純化核酸。
如果有分析、定量 需求可整合 reader,亦可與TECAN 系統作自動化整合。